Можно ли предусмотреть в положении о закупках размер аванса 90% при этом не устанавливать размер обеспечения исполнения контракта в размере аванса

Размер аванса: Прямого запрета для это в Законе №223-ФЗ не установлено. При этом в соответствии пунктом 3.11-1 статьи 2 Федерального закона от 03.11.2006 № 174-ФЗ “Об автономных учреждениях” автономные учреждения, при заключении контрактов (договоров) о поставке товаров, выполнении работ, оказании услуг, предусматривающих авансовые платежи, соблюдают требования, определенные нормативными правовыми актами Российской Федерации, нормативными правовыми актами субъектов Российской Федерации, муниципальными правовыми актами, регулирующими бюджетные правоотношения, для получателей средств соответствующего бюджета бюджетной системы Российской Федерации. В связи с этим не рекомендуем указывать размер аванса в Положении, т.к. это определяется иными нормативно-правовыми актами.
Размер ОИД при проведении закупок (за искл. закупок у МСП) Заказчик может установить самостоятельно и в НПА дополнительных требований не установлено.
Размер ОИД при проведении закупок у МСП регулируется ПП1352. С одной стороны, Закон №223-ФЗ не устанавливает обязанности устанавливать ОИД в закупке, но при этом в соответствии с подпунктом б) пункта 25 ПП1352 ОИД устанавливается в размере аванса, если договором предусмотрена выплата аванса. Считаем, что в данном в случае в приоритете, нормы Закона и Заказчик не обязан устанавливать ОИД (в т.ч. при наличии авансовых платежей). При этом если такое требование установлено и предусмотрен аванс, то ОИД устанавливается в размере аванса.
Резюме по 1-3: В Положении о закупке рекомендуется указать базовые принципы, установленные Законом №223 и ПП1352 и не устанавливать конкретные значения, которые могут им противоречить (например, при изменении Закона) или не соответствовать смежным НПА. Лучше делать ссылки на соответствующие разделы Закона. Случай, указанный вами в вопросе лучше регулировать при формировании документации о закупке.