Можем ли мы повторно вынести мотивированный отказ в приемке работ?

Можно, если это не противоречит условиям заключенного контракта. В соответствии с п.1 ст. 723 ГК РФ если подрядчик выполнил работу ненадлежащего качества, то есть с отступлениями от договора подряда, ухудшившими результат работы, или с иными недостатками, которые делают результат не пригодным для обычного либо предусмотренного в договоре использования, если иное не предусмотрено договором подряда, заказчик вправе потребовать от подрядчика безвозмездного устранения недостатков в разумный срок. Количество отказов в приемке в законе не оговаривается. Но, в соответствии с п.3 ст.723 ГК РФ если отступления в работе от условий договора подряда или иные недостатки результата работы в установленный заказчиком разумный срок не были устранены либо являются существенными и неустранимыми, заказчик вправе отказаться от исполнения договора и потребовать возмещения причиненных убытков, что также подтверждается нормами ч.9 ст.95 Закона №44-ФЗ.