Набор реагентов и других связанных с ними материалов, предназначенный для качественного и/или количественного определения нуклеиновой кислоты, в том числе специфических маркеров генов, выделенных из бактерии Clostridium difficile, в клиническом образце и/или изоляте культуры методом анализа нуклеиновых кислот. Определяемые маркеры могут включать гены, обеспечивающие устойчивость к антимикробными препаратам (например, ген gyrA), вирулентность (например, риботип 027) и гены, кодирующие продукцию токсинов A и/или B.